8月25日，有毕业生在社交平台反映，自己已于6月毕业，但绑定的学校银行卡在当天被扣除8053元，扣款方显示为华南农业大学。随后有多位网友表示遇到类似情况，也有学生因银行卡余额不足导致扣款未成功。

一位受影响学生称，25日14时43分收到扣款通知后立即联系辅导员，辅导员最初表示学校会在3至5个工作日内退回误扣款项，但该学生在大约一小时后就收到了退款。

8月26日，华南农业大学财务处工作人员表示，学校已查明问题：在为新生扣缴学费时，系统出现异常，误将部分已毕业学生的账户也进行了扣款。工作人员解释，学生入学时通常在银行APP上签署了“代缴学费”协议。 球友会

校园卡科工作人员称，问题发现后已在25日下午5点前将所有误扣款项按原路退还，学生无需手动取消代缴协议，银行卡功能不受影响。学校表示此类错误不会再发生，仍未收到退款的学生可联系财务处查询。